Naruto Shippuuden adalah kelanjutan dari serial TV animasi asli Naruto. Kisah ini berkisah tentang Uzumaki Naruto yang lebih tua dan sedikit lebih matang dan upayanya untuk menyelamatkan temannya Uchiha Sasuke dari cengkeraman Shinobi seperti ular, Orochimaru. Setelah 2 setengah tahun, Naruto akhirnya kembali ke desanya Konoha, dan mulai mewujudkan ambisinya, meskipun itu tidak akan mudah, karena Ia telah mengumpulkan beberapa musuh (lebih berbahaya), seperti organisasi shinobi. ; Akatsuki.

Ketika Banagher Links bertemu dengan Audrey Burne yang misterius, ia mewarisi Unicorn Gundam dan terseret dalam pertempuran perebutan kemerdekaan koloni luar angkasa.

Untuk membantu memadamkan gelombang kejahatan ini, ada sekelompok ninja wanita yang memburu dan membunuh iblis-iblis yang bermaksud menyakiti orang lain. Asagi Igawa adalah salah satu ninja ini, atau setidaknya, dia. Hari-hari berburu iblisnya telah dikesampingkan demi bersama pacarnya, Sawaki. Sayangnya untuk pasangan itu, masa lalu Asagi tidak sejauh yang dia pikirkan. Musuhnya yang sebelumnya dikalahkan, Oboro, entah bagaimana kembali dari kubur untuk membalas dendam. Balas dendam di dunia Taimanin Asagi yang bengkok bukanlah sesuatu yang sesederhana kematian. Pada saat Oboro selesai, Asagi dan saudara perempuan shinobinya, Sakura, akan diubah secara seksual dan fisik dan disiksa sampai ke dasar kebobrokan. Asagi akan mengetahui bahwa tidak ada pelatihannya sebagai ninja yang bisa mempersiapkannya untuk kekuatan yang dimiliki kesenangan saat digunakan sebagai senjata.

Pekerjaan baru Futuba Igarashi akan sangat bagus jika senpainya, Harumi Takeda, tidak terlalu menyebalkan! Futuba membenci tawanya, dia membenci seberapa besar dia, dan dia benar-benar benci bahwa dia memperlakukannya seperti anak kecil. Hanya karena Futuba pendek dan terlihat muda tidak membuatnya seperti anak kecil, dan hanya karena dia menghabiskan begitu banyak waktu dengan Takeda bukan berarti dia menganggapnya sebagai senpai yang menyebalkan...atau dia?!

Selama dia bisa ingat, Ichigo Kurosaki telah dapat melihat hantu. Tetapi ketika dia bertemu Rukia, Penuai Jiwa yang memerangi roh jahat yang dikenal sebagai Hollows, dia menemukan hidupnya berubah selamanya. Sekarang, dengan kekayaan energi spiritual yang baru ditemukan, Ichigo menemukan panggilan sejatinya: untuk melindungi yang hidup dan yang mati dari kejahatan.

Meskipun diintimidasi, dicemooh, dan ditindas sepanjang hidupnya, seorang pria berusia 34 tahun yang tertutup masih menemukan tekad untuk mencoba sesuatu yang heroik hanya untuk berakhir dengan kecelakaan tragis. Namun dalam takdir yang berubah, dia terbangun di dunia lain sebagai Rudeus Greyrat, memulai hidup kembali sebagai bayi yang lahir dari dua orang tua yang penuh kasih. Mempertahankan ingatan dan pengetahuannya dari kehidupan sebelumnya, Rudeus dengan cepat beradaptasi dengan lingkungan barunya. Dengan pemikiran orang dewasa yang sudah dewasa, ia mulai menampilkan bakat magis yang melebihi semua ekspektasi, mengasah kemampuannya dengan bantuan seorang mage bernama Roxy Migurdia. Rudeus belajar permainan pedang dari ayahnya, Paul, dan bertemu dengan Sylphiette, seorang gadis seusianya yang dengan cepat menjadi teman terdekatnya.

Saat tujuh robot paling canggih di dunia dan para sekutu manusia mereka dibunuh satu per satu, Inspektur Gesicht segera menyadari bahwa ia juga dalam bahaya.