Mengambil setting empat tahun setelah petualangan di film pertama. Jack Reacher (Tom Cruise) kembali ke markas dari unit ia dulu bekerja. Namun disana, ia dituduh terlibat atas pembunuhan yang terjadi 16 tahun yang lalu. Ia juga menemukan bahwa atasannya terdahulu, Susan Turner (Cobie Smulders), ditangkap atas tuduhan pengkhianatan. Yakin bahwa atasannya tidak bersalah, Jack berniat untuk membebaskan Susan dari penjara, dan mengungkap kebenaran dibalik konspirasi pemerintah yang melibatkan mereka. Dalam pelarian, Jack baru mengetahui kalau ia hanyalah bagian kecil dari sebuah rahasia besar, yang berhubungan dengan masa lalunya.

Tony Lip, seorang tukang pukul pada tahun 1962, dipekerjakan untuk mengantar pianis Don Shirley dalam tur melintasi Deep South pada masa ketika orang Afrika-Amerika, yang dipaksa mencari akomodasi dan layanan alternatif karena undang-undang segregasi di bawah Mason-Dixon Line, mengandalkan panduan yang disebut The Negro Motorist Green Book.