Seorang ayah dan anak laki-laki, keduanya petugas koroner, ditarik ke dalam misteri yang kompleks saat mencoba mengidentifikasi tubuh seorang wanita muda, yang tampaknya menyimpan rahasia kelam.

Tujuh puluh tahun sebelum Harry Potter membaca buku pelajaran yang ditulis oleh Newt Scamander (Eddie Redmayne) di Hogwarts, sang penulis berkelana mengunjungi perkumpulan rahasia penyihir di kota New York. Spin-off film Harry Potter yang berlatar belakang di tahun 1926 ini menceritakan kisah perjalanan Newt yang bepergian keliling dunia untuk bertemu dan mendokumentasikan hewan-hewan sihir. Akan tetapi ketika ia bersinggah di kota New York sebelum mengakhiri perjalanannya, Newt tidak sengaja melepaskan hewan-hewan sihir yang disimpannya di dalam koper sihir miliknya di dunia No-Maj (manusia tanpa kemampuan sihir).

Reynolds Woodcock, seorang perancang busana, memiliki kehidupan yang tertata rapi. Namun semuanya berubah drastis saat ia menyukai Alma, seorang pelayan yang menjadi inspirasi dan kekasihnya.