Satu set enam cerita bersarang yang mencakup waktu antara abad ke-19 dan masa depan pasca-apokaliptik yang jauh. Cloud Atlas mengeksplorasi bagaimana tindakan dan konsekuensi dari kehidupan individu berdampak satu sama lain di masa lalu, sekarang dan masa depan. Aksi, misteri, dan romantisme menjalin kisah ini ketika satu jiwa dibentuk dari seorang pembunuh menjadi seorang pahlawan dan satu tindakan kebaikan mengalir di seluruh abad untuk menginspirasi revolusi di masa depan yang jauh.

Kotak ditinggalkan bagi orang-orang untuk secara anonim menurunkan bayi mereka yang tidak diinginkan.

Siswa SMA Sohee memulai pelatihan kerja di pusat panggilan, tetapi dia menghadapi tekanan perusahaan yang serakah. Detektif Oh Yu-jin, yang memiliki kesamaan dengan Sohee mulai mengikuti jejak untuk mengungkap kebenaran.

Kala kekuatan zalim Motherworld mengancam desa pertanian yang tenteram di bulan nan jauh, sesosok pendatang misterius menjadi tumpuan harapan mereka untuk bertahan.

Para pemberontak bersiap untuk bertempur melawan kekuatan jahat Motherworld kala ikatan-ikatan kuat terjalin, pahlawan-pahlawan bangkit, dan legenda-legenda terlahir.